Zarząd Polskiego Radia S.A. na posiedzeniu w dniu 23 lutego 2012 roku podjął decyzję o likwidacji Chóru Polskiego Radia w Krakowie. Spółka w obecnej sytuacji ekonomicznej nie jest w stanie samodzielnie finansować zespołu. Jednocześnie władze publicznego nadawcy przedstawiły propozycje utrzymania działalności Chóru poza strukturami firmy, zapewniając mu długookresowe wsparcie. Zarząd PR tłumaczy swoją decyzję wskazując, że krakowski zespół znajduje się "w historycznie najtrudniejszej sytuacji finansowej".
Pierwsze apele o ratowanie Chóru trafiły do władz miasta i województwa już w 2009 roku. Podpisali je m.in. Krzysztof Penderecki i Wojciech Kilar. Trafiły nie tylko do władz miasta i województwa, ale też do ministra kultury Bogdana Zdrojewskiego. Ten zadeklarował dofinansowanie w wysokości 800 tys. zł, ale lokalne władze nie zmieniły zdania. Zarząd PR podjął więc decyzję o rozwiązaniu chóru. Zaproponował, by przekształcił się on w stowarzyszenie, z gwarantowanym corocznym budżetem 1,3 mln zł. Aleksander Małkiewicz, p.o. dyrektora zespołu, uważa jednak, że stowarzyszenie nie daje gwarancji skutecznego działania i prędzej czy później doprowadzi do uśmiercania chóru. Jeśli decyzję Zarządu zatwierdzi Rada Nadzorcza PR, w kwietniu 2012 rozpoczną się zwolnienia w chórze, a do jesieni zespół przestanie istnieć.